mRNA sekvenační knihovny

Příprava knihovny z kompletních mRNA vláken

Soupravy Takara Bio mRNA-Seq jsou založeny na technologii SMART (Switching Mechanism at 5' End of RNA Template) pro syntézu cDNA, která umožňuje zachytit celou sekvenci transkriptu mRNA. Soupravy poskytují vysoce kvalitní data z malého množství vstupního materiálu, jsou robustní a snadno se používají. Získané sekvenační knihovny jsou kompatibilní s platformami Illumina. Společnost Takara Bio rovněž poskytuje uživatelsky přívětivý bioinformatický software Cogent pro rychlou analýzu a vizualizaci dat.

Hlavní vlastnosti:

Poskytují informace o celé délce transkriptu
Protokol s jednou zkumavkou pro minimální ztrátu vzorku
Pracuje s ultra nízkými a jednobuněčnými vstupy
Plná délka oligo(dT) primingu
S kompatibilními UDI lze multiplexovat až 384 vzorků
Knihovny kompatibilní se sekvenačními platformami Illumina

DOSTUPNÉ PRODUKTY:

SMART-Seq® mRNA LP (s UMI)

Vstupní rozsah: 10 pg-100 ng celkové RNA (RIN ≥ 8) nebo 1-1 000 buněk.
Obsahuje UMI pro vyšší přesnost
Zahrnuje syntézu cDNA a chemii pro přípravu knihovny
UDI se prodávají samostatně

SMART-Seq® mRNA LP

Vstupní rozsah: 10 pg-100 ng celkové RNA (RIN ≥ 8 nebo 1-1 000 buněk).
Určeno pro syntézu cDNA a přípravu knihovny
Identifikace nejvyššího počtu genů; detekce genových fúzí, izoforem, SNP.
UDI se prodávají samostatně

SMART-Seq® mRNA

Vstupní rozsah: 10 pg-100 ng celkové RNA (RIN ≥ 8) nebo 1-1 000 buněk.
Určeno pro syntézu cDNA

SMART-Seq® mRNA Single Cell LP

Vstupní rozsah: Rozsah: 1 buňka
Robustní chemie plné délky
Určeno pro syntézu cDNA a přípravu knihoven

Funguje dobře i u buněk s velmi nízkým obsahem RNA a jader
Vhodná pro automatizaci
UDI se prodávají samostatně

SMART-Seq® mRNA HT LP

Vstupní rozsah: 1-100 buněk nebo 10 pg-1 ng celkové RNA
Snadno automatizovatelný pracovní postup
Zachycení pokrytí transkriptů v plné délce, nízké procento čtení rRNA a široké zastoupení transkriptů bohatých na GC
Navrženo pro syntézu cDNA a přípravu knihoven
UDI se prodávají samostatně