Platforma Tapestri
Platforma pro single-cell multi-omickou DNA analýzu pro odhalení genetické diverzity napříč buněčnými populacemi
Kapénková mikrofluidní platforma umožňuje přístup k DNA na úrovni jednotlivých buněk. Pracovní postup s dvoustupňovou enkapsulací poskytuje flexibilitu pro přizpůsobení. Uvolněná, barkodovaná a amplifikovaná DNA je připravena k přípravě NGS knihoven.
Hlavní vlastnosti:
- Cílená detekce SNV, CNVs a proteinů současně ze stejné buňky
- Informace o genotypu a fenotypu
- Získání jednobuněčné DNA z až 10 000 buněk
- Detekce vzácných subklonů až na úroveň 0,1 %
- Odhalte skutečnou heterogenitu buněčné populace
- Analýza klonální architektury nebo společného výskytu mutací pro monitorování odpovědi na léčbu, rezistence a/nebo relapsu
- Jednoduchý pracovní postup a uživatelsky přívětivý bioinformatický software
- Katalogové, publikované a virtuální panely, přizpůsobitelný obsah
- Kompatibilní s platformou Illumina NGS
Pracovní postup Tapestri
1. enkapsulace: Rozdělení buněk do kapiček spolu s enzymatickou směsí s proteázou.
2. enkapsulace: Buněčný lyzát kombinovaný s barkodovanými kuličkami, primery a činidly pro amplifikaci pro označení každého amplikonu jedinečným čárovým kódem pro identifikaci buňky.
Další kroky: Příprava a sekvenování knihoven na platformách Illumina NGS (MiSeq, NextSeq 550, HiSeq 2500, HiSeq 4000, NovaSeq 6000), analýza a vizualizace dat pomocí Mission Bio Software
