Sekvenování celkové RNA

Soupravy Takara Bio pro sekvenoví celkové RNA umožňují generovat knihovny ze vstupů s různým množstvím RNA, díky čemuž jsou vhodné pro práci s degradovanými vzorky, jako je například FFPE. Soupravy využívají náhodné hexamery pro priming a generují transkriptomická data ze vzorku RNA.

Hlavní vlastnosti:

• Metoda pro analýzu kódující i nekódující RNA
• Pro RNA jakékoli integrity (RIN 2-10), včetně degradované RNA (např. vzorky FFPE).
• Identifikace nekódující i antisense RNA
• Poskytují informací o celém vláknu RNA
• Protokoly bez ligázy
• Multiplexování až 384 vzorků
• UDIs se prodávají samostatně

DOSTUPNÉ PRODUKTY:

SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR® Mammalian)

• Vstupní materiál: 1-1 000 intaktních savčích buněk nebo 10 pg-10 ng (RIN >4).
• Knihovny připravené za ~6,5 hodiny
• Obsahuje 8 nukleotidů (nt) unikátního molekulárního identifikátoru (UMI).
• Chemie pro depleci rRNA savců je součástí soupravy (ZapR Mammalian).

SMART-Seq® Total RNA Pico Input s UMI (ZapR® Mammalian)

• Vstupní materiál: 250 pg-10 ng celkové RNA (RIN 2-10) z člověka, myši nebo potkana
• Alternativní protokol pro vyšší vstupní množství materiálu: mezi 10 ng-1 µg
• Protokol je hotový za 6,5 hodiny
• Obsahuje 8 nukleotidů (nt) unikátního molekulárního identifikátoru (UMI)
• Chemie pro depleci rRNA savců je součástí soupravy (ZapR Mammalian).

SMART-Seq® Total RNA Pico Input (ZapR® Mammalian)

• Vstupní materiál: 250 pg-10 ng celkové RNA (RIN 2-10) z člověka, myši nebo potkana.
• Alternativní protokol pro vyšší vstupní množství materiálu: zšířený vstupní rozsah mezi 10 ng-1 µg
• Protokol je hotový za 6,5 hodiny
• Chemie pro depleci rRNA savců je součástí soupravy (ZapR Mammalian).

SMART-Seq® Total RNA Mid Input

• Vstupní množství RNA: 100 pg
• Doporučený vstupní materiál: RNA zbavená rRNA nebo poly(A)-purifikovaná RNA
• Příprava knihovny za 4 hodiny

SMART-Seq Total RNA High Input (RiboGone Mammalian)

• Vstupní materiál: 100 ng-1 µg celkové RNA (RIN 3-10) z člověka, myši nebo potkana
• Knihovna připravena za 5 hodin
• Chemie pro depleci rRNA savců je součástí soupravy (RiboGone Mammalian).